Kan niemand dan hier wat aan doen?
Nou, de mensen op dit forum niet. ;-)

Zou dus maar met de NS reizen; scheelt een hoop geld.

Elke vervoerder rekent eigen prijzen.

Maakt u de andere reis via Deventer / Apeldoorn? Die afstandzal korter zijn.
Wel is het zo dat vervoerders verscillende tarieven benutten zoals bijv lijn 43 Apeldoorn - Arnhem via Dieren die door zowel Breng als Syntys wordt gereden.

Tip: ga eens na wat een e-ticket kost, besteld bij NS van Wierden naar Schiphol, daarmee kunt u ook met andere vervoerders reizen en zou het best eens zo kunnen zijn dat het dan via Zwolle goedkoper is dan u nu aangeeft.

Kennelijk zijn een hoop mensen bezig met jouw vraag, want ineens ligt de reisplanner er uit.
Op de reisplanner zag ik dat je vanaf Wierden alleen met Blauwnet daar of Zwolle of Deventr kunt. 
De NS stopt niet in Wierden. 
Bij de prijs van de rit van de NS, komt nog de prijs van het kaartje van Blauwnet.
Reizen over Deventer is iets goedkoper, mogelijk een paar km korter.
Wierden- Deventer kost €6,80. 
Kijk het nog eens na.

Waarom betaal ik voor de koffie meer bij de AH dan bij de Jumbo? Kijk ik op de site van AH staat daat de prijs van de Jumbo niet. Je wordt gewoon bedonderd.
Ieder bedrijf mag zijn eigen prijzen hanteren. Dat mag omdat wij in een vrij Nederland wonen. U als klant mag dan zelf bepalen wat u wilt. U kunt kiezen tussen 2 verschillende treinbedrijven met bijbehorende prijzen. 
En natuurlijk heeft de NS geen inzicht in de prijzen van andere aanbieders. Net zo goed dat de AH de prijs niet weet van de Jumbo.

Dat heeft met vrije markt en concurrentie te maken. Dat u zich "beduveld" voelt wil nog niet zeggen dat u "beduveld" wordt.
Heeft u weleens de kosten van vliegreizen vergeleken?

Ik heb er nooit om gevraagd dat er meerdere aanbieders op het spoornet zijn en waarom worden die prijzen niet zo aangepast dat je als reiziger gewoon altijd dezelfde prijs betaalt?
Hebben de aanbieders uw toestemming nodig om hun vervoersdiensten aan te bieden? Ik dacht het niet. De prijzen worden niet aangepast, omdat elke aanbieder een andere prijs rekent voor door hem verleende diensten. 

Als reiziger weet je vaak niet dat je gewoon beduveld wordt, want zo voelt het. 
Niemand wordt beduveld. Dat u zich zo voelt, maakt het natuurlijk niet meteen zo. U vergelijkt meerdere vervoerders. De een is duurder dan de ander. Waarom zou dit beduvelen moeten zijn? De ene vliegmaatschappij is duurder dan de ander. De ene garage is duurder dan de ander en de ene supermarkt is duurder dan de ander. U heeft de keuze: kies de goedkope optie, kies de duurdere optie, pak de auto of blijf gewoon thuis. 

Kan niemand dan hier wat aan doen?
Nee.

Volgens de NS reisplanner is het verschil €0,98.
U telt de prijs afzonderlijke trajecten bij elkaar op en dat klopt niet. De spoorwegen hebben allemaal een staffeltarief, waardoor de prijs per kilometer afneemt met de lengte van uw treinreis.
U kunt uw vraag ook stellen op het forum van de NS: https://forum.ns.nl/

NS stop wél in Wierden: met de stoptreinen Almelo - Deventer - Apeldoorn.
De reisplanner 9292 (niet de NS-planner) geeft de tarieven via de verschillende routes naast elkaar: inderdaad scheelt het maar 92 cent als je de route niet opknipt.
En dat terwijl de route via Zwolle langer is dan via Amersfoort: 161 'tariefeenheden' via Zwolle om 147 via Amersfoort.
https://www.rijdendetreinen.nl/tickets/tariefafstanden 
Al zijn die tariefeenheden niet per se de echte kilometers.